GRID-seq，一种可以捕获全基因组范围的DNA-RNA相互作用技术。2017年，来自加州大学的付向东研究团队，研发了一种无偏差地检测全部染色质-RNA相互作用的技术：GRID-seq（Global RNA interactions with DNA by deep sequencing），相关论文发表在了Nature Biotechnology上。

1. 预先设计特殊的linker，一端是单链RNA，另一端是双链DNA

2. 用DSG和甲醛固定RNA-DNA相互作用，提取细胞核

3. 用AluI 进行酶切

4. 加入linker，linker的RNA与要捕获的RNA连接

5. 反转录，扩增连接的RNA

6. 去除游离的linker

7. linker的DNA与要捕获的DNA连接

8. 用整合素磁珠捕获DNA

9. 从磁珠释放ssDNA，合成dsDNA，使用MmeI，将linker上设计好的酶切位点切开

10. 跑胶，得到两个DNA片段，85bp的是连接了RNA和DNA的linker，65bp的是只连接了RNA或者DNA的linker。