技术简介

      CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation) 是一种研究蛋白质与DNA 互作的新方法。该方法将高活性的Tn5 转座酶与Protein A 融合，并装载建库接头形成pA-Tn5 转座复合物。在抗体的引导下该pA-Tn5 转座复合物可靶向切割目的蛋白附近的DNA 序列，同时给这些切割的DNA 加上测序接头。

      CUT&Tag 技术可从基因组范围内检测组蛋白修饰和转录因子结合的DNA 区段，产生的数据类型和ChIP-seq 技术一致。

      CUT&Tag 的实验时间短，实验过程未对细胞核和染色质进行物理性的破坏，整个操作过程相对“温和”。因此CUT&Tag 的背景噪音比较低，信噪比高，对起始细胞量的要求大幅减少，操作简单且数据可重复性好，适用于样本量少的组织或者细胞，目前已广泛应用于动植物的基础研究。

技术流程

技术应用

1. 判断DNA 链的某一特定位置是否发生某种组蛋白修饰^[1]；

2. 检测RNA polymerase II 及其它反式因子在基因组上结合位点的精确定位^[2]；

3. 研究组蛋白共价修饰与基因表达的关系^[3]；

4. 转录因子结合位点研究^[4]。

技术优势

  CUT&Tag 省掉了甲醛交联、超声破碎和加测序接头的额外工作，使实验时间大大缩短，同时因为检测的灵敏度高，所需的样品的起始量低。

参考文献：

[1]Zenk F, Cardamone F, Ibarra Morales DA, Atinbayeva N, Zhan Y, oIvino N. Analyzing the Genome-Wide Distribution of Histone Marks by CUT&Tag in Drosophila Embryos. Methods Mol Biol. 2023;2655:1-17. doi: 10.1007/978-1-0716-3143-0_1. PMID: 37212984.

[2]Kaya-Okur HS, Wu SJ, Codomo CA, Pledger ES, Bryson TD, Henikof fJG, Ahmad K, Henikoff S. CUT&Tag for efficient epigenomic proifling of small samples and single cells. Nat Commun. 2019 Apr 29;10(1):1930. doi: 10.1038/s41467-019-09982-5. PMID: 31036827; PMCID: PMC6488672.

[3]Tao XY, Guan XY, Hong GJ, He YQ, Li SJ, Feng SL, Wang J, Chen G, Xu F, Wang JW, Xu SC. Biotinylated Tn5 transposase-mediated CUT&Tag efficiently profiles transcription factor-DNA interactions in plants. Plant Biotechnol J. 2023 Jun;21(6):1191-1205. doi: 10.1111/pbi.14029. Epub 2023 Mar 2. PMID: 36786225; PMCID: PMC10214755.

[4]Tao XY, Guan XY, Hong GJ, He YQ, Li SJ, Feng SL, Wang J, Chen G, Xu F, Wang JW, Xu SC. Biotinylated Tn5 transposase-mediated CUT&Tag efficiently profiles transcription factor-DNA interactions in plants. Plant Biotechnol J. 2023 Jun;21(6):1191-1205. doi: 10.1111/pbi.14029. Epub 2023 Mar 2. PMID: 36786225; PMCID: PMC10214755.

技术服务

睿锶生物具有多年的CUT&Tag 实验和数据分析经验，产生了多种动植物的高质量的CUT&Tag 实验数据。