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HiChIP

HiChIP(in situ *Hi-C followed by chromatin immunoprecipitation)是一种利用原位Hi-C原理和转座酶介导构建文库来解析染色质构象的方法。该方法由Howard Chang实验室建立,相关方法论文在2016年11月份发表于 Nature Methods.




服务流程

1. 用甲醛铰链DNA和蛋白,目的是让可能存在相互影响的DNA片段连接;

2. 用超声等方法将DNA片段化;

3. 用特异性蛋白抗体富集DNA和蛋白复合物;

4. 在DNA片段末端加上包含MmeI位点的生物素化寡核苷酸linker;

5. 连接linker,从而形成连接目的DNA片段的桥梁;

6. 用限制性内切酶消化得到DNA片段,去除蛋白质;

7. 固定化PET序列;

8. 上机测序。

ChiA

细胞样品

反应所需细胞应大于10million/管(每个样本准备2~3管),具体细节详询销售。



动物组织

选取新鲜组织,质量大于100mg/份,取样时剔除冗余部分,保证组织的单一性,建议取材后用生理盐水漂洗,以去除血渍和污物,液氮速冻,-80℃保存。建议样品制备 2~3 份。



植物组织

选取取幼嫩组织,如嫩叶,根尖,幼苗等,质量大于5g/份,建议取样后用清水漂洗去除污物,纸巾吸干水分后液氮速冻,-80℃保存。建议样品制备 2~3 份。


具体细节,详询销售或技术人员。


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